Sólo existen un par de especies de manta rayas en el mundo. Una de ellas es gigante, siendo la otra especie mucho más pequeña. En el 2008 se confirmó que una nueva especie de manta raya había sido descubierta, antes se creía que era la misma especie que crecía en tamaños diferentes en distintas áreas, ahora sabemos que son especies diferentes debido a las pruebas de ADN y otros de datos utilizados por los profesionales.
En este momento simplemente se clasifican como manta rayas grandes y pequeñas. Las especies más grandes tienden a migrar más que las más pequeñas, se encuentran en lugares donde el agua es cálida todo el mundo. Las especies más pequeñas de manta raya tienden a estar más cerca de los arrecifes de coral, son las que probablemente vea si visita Hawái, Australia o Japón.
Las dos especies se cree que permanecen casi completamente separados unos de otros. El único lugar donde han sido vistos alrededor de la misma área es en Mozambique. Esta información se basa en cinco años de investigación independiente, llevada a cabo por la Fundación Save our Seas(Salve a nuestros mares) fuera de Suiza.
Las pruebas demuestran que las manta rayas han existido durante millones de años, son muy inteligentes y tienen cuerpos hechos para moverse en el agua, sin embargo, las amenazas por parte de los seres humanos pueden llegar a ser demasiado para estos peces. Si los humanos seguimos explotando el hábitat natural de estas criaturas no podrán encontrar suficiente alimento, haciendo su futuro cuestionable.
Se añade el hecho de que muchos seres humanos contaminan las aguas con toxinas, lo que provoca la muerte de un gran número de de mantas rayas debido a las bacterias. El apareamiento es menos probable que ocurra cuando las condiciones no son optimas, la hembra manta rayas también es capaz de abortar a sus hijos cuando están embarazadas y sienten que están amenazados, como resultado existen serias dudas sobre los números de mantas rayas en declive.
Muchos expertos creen que existen más especies de manta rayas y simplemente, no las hemos descubierto todavía.
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